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Formation - Cytométrie en flux : retraitement des données avec FlowJo

Environnement scientifique et technique de la formation

Institut Toulousain des maladies infectieuses et inflammatoires

- UMR 5051
RESPONSABLE

Anne-Laure ISCACHE

Ingénieure d'études

UMR 5051

LIEU

distance (00)

ORGANISATION

2 jours et demi
De 4 à 10 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Alternance de cours (6 h) et de travaux dirigés (11 h)
La partie théorique est réalisée en cours magistral à l'aide d'un tutoriel remis aux participants lors de la formation et d'une démonstration sur logiciel.
La partie pratique est réalisée sur poste informatique. Analyses communes avec des fichiers de données remis le jour de la formation.
Tout au long de la formation, des exercices corrigés permettront au stagiaire d'évaluer son acquisition des connaissances.
Un support papier et/ou des fichiers au format PDF seront mis à disposition du stagiaire.

COÛT PÉDAGOGIQUE

927 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

25209 : du mercredi 18/06/2025 au vendredi 20/06/2025 à distance

2025
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin
25209
Juillet Août
Sept Oct Nov Déc
À distance
OBJECTIFS
-

Connaître les outils de base de FlowJo pour l'analyse de données de cytométrie en flux multiparamétrique


-

Savoir modifier et créer une matrice de compensation


-

Faire des analyses automatisées simples (batch simple) et complexes (analyses multiparamétriques ou expériences de variables multiples patients, dates, batch complexe)


-

Connaître et comprendre les modules d'analyses spécifiques de cytométrie en flux (cycle cellulaire, prolifération)

PUBLICS
Chercheurs, ingénieurs et techniciens exerçant dans le domaine des sciences du vivant
Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.

Prérequis
: avoir une bonne pratique et compréhension de la cytométrie en flux ; aucun prérequis en termes de maîtrise du logiciel FlowJo
PROGRAMME
Cette formation permet aux stagiaires de maîtriser l'ensemble des outils disponibles avec le logiciel FlowJo pour analyser des données multiparamétriques de cytométrie en toute autonomie Ce stage pourra être poursuivi par une formation consacrée aux analyses avancées "Cytométrie en Flux : Analyses multidimensionnelles non supervisées à l'aide du logiciel FlowJo – Niveau Expert".

- Présentation générale du logiciel et de ses fonctionnalités
- Présentation des outils de base au travers d'une analyse simple :
. Workspace : organisation de l'espace de travail, comment créer / modifier une stratégie d'analyse et l'appliquer
. Table Editor : création de rapports statistiques simples
. Layout Editor : création de rapports graphiques simples (batch, overlay, mise en page)
- Compensations : rappels des principes de compensation, contrôler et valider la matrice de compensation.
- Création d'une matrice de compensation en mode automatique
- Réglages des préférences du logiciel
- Organisation et automatisation de l'expérience : création automatique de groupes, itération, mots clés, métadonnées, fonction concaténation
- Création de rapports statistiques complexes : création de formules, mise en forme des résultats statistiques (heat map, valeur de référence)
- Création de rapports graphiques complexes : Batch complexes (itération par panel, mots clés)
- Utilisation des modules d'analyses spécifiques de cytométrie en flux (cycle cellulaire, prolifération)

Dernière demi-journée consacrée à l'analyse de jeux de données apportés par les stagiaires à des fins pédagogiques sous réserve de l'accord préalable de la responsable de la formation.
EQUIPEMENT
Il sera demandé aux participants de venir avec leur propre ordinateur.
Avis des stagiaires

"Très bonne formation, très utile et complète, basée sur la pratique. Merci !" Gwenaëlle L., Institut de recherche