Formation - Epigénétique : concepts, techniques - introduction

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Environnement scientifique et technique de la formation

Interactions hôtes-pathogènes-environnements

- UMR 5244

RESPONSABLES

Christoph GRUNAU

Professeur

UMR 5244

Cristian CHAPPARO

Ingénieur de recherche

UMR 5244

LIEU

distance (00)

ORGANISATION

16 h sur 4 demi-journées (matins)
De 3 à 12 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

- Formation à distance
- 1 groupe : 3 x 4 heures de cours, 4 heures de TD
- 2 groupes : 3 x 4 heures de cours, 2 x 4 heures de TD
Des debriefings à la fin de chaque demi-journée permettront au stagiaire d'évaluer l'acquisition des connaissances.
Des supports dématérialisés et un lien vers des ouvrages seront mis à disposition du stagiaire.
Tout au long de la formation, des cas pratiques ou exercices corrigés permettront à l'apprenant d'évaluer l'acquisition des compétences.

COÛT PÉDAGOGIQUE

927 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

25230 : du lundi 30/06/2025 au jeudi 03/07/2025 à distance

2025

Janvier	Février	Mars	Avril
Mai	Juin 25230	Juillet	Août
Sept	Oct	Nov	Déc

À distance

OBJECTIFS

Comprendre les nombreuses perspectives et les limites des études en épigénétique

Identifier les différents porteurs de l'information épigénétique et leurs interactions

Connaître les avantages et limites des méthodes actuelles et savoir les choisir selon les questions biologiques

Apprendre les bases de l'analyse bio-informatique pour être capable de dialoguer avec des bio-informaticiens et effectuer des analyses simples sur l'interface Galaxy

PUBLICS

Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, IR, IE, AI, responsables et personnel de plateformes.

Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription

PRÉREQUIS

Connaissances de base en biologie moléculaire, intérêt en épigénétique

PROGRAMME

Ces dernières années, des découvertes expérimentales ont mis en évidence une forme d'hérédité indépendante de la séquence de l'ADN. Cette information non-génétique, appelée épigénétique, se manifeste par des mécanismes modifiant les fonctions des gènes sans altérer la séquence d'ADN elle-même. Une fois ces modifications acquises, elles peuvent être transmises lors des divisions cellulaires et d'une génération à l'autre chez les organismes pluricellulaires.

Les informations épigénétiques peuvent être stockées de diverses façons. Parmi celles-ci, la méthylation de l'ADN est la plus étudiée, suivie par les modifications des histones. Une méthode émergente, l'ATAC-seq, offre une image précise de l'accessibilité de la chromatine et permet d'identifier les régions génomiques présentant des structures chromatiniques polymorphes. Grâce à notre expertise en tant que plateforme d'Épigénomique Environnementale, nous proposons une formation répondant aux besoins de formation théorique de base sur les concepts et les techniques d'analyse en épigénétique.

La formation a lieu en ligne et se déroule sur 4 demi-journées.

Jour 1
La formation commence par 2 demi-journées avec une introduction couvrant les définitions et les différents concepts de l'épigénétique, la méthylation de l'ADN et les méthodes d'analyse associées, des explications des modifications des histones, la méthode de ChIP-Seq, ainsi que l'analyse de la structure de chromatine par l'ATAC-Seq. Une introduction à l'utilisation de l'interface bio-informatique Galaxy est également prévue.

Jour 2
Par la suite, le programme s'adapte aux besoins des participants sur deux autres demi-journées. Le travail s'effectue en un ou deux groupes, comprenant des questionnaires et des activités collaboratives à distance.

EQUIPEMENT

Ordinateur avec équipement de visioconférence (camera et microphone), autorisation d'utiliser Zoom

INTERVENANTS

C. Chaparro (ingénieur), C. Grunau et S. Maury (professeurs)

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