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Formation - Scripts en Python pour la bioinformatique et environnement Linux

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RESPONSABLE

Eric RIVALS

Directeur de recherche

UMR 5506

LIEU

MONTPELLIER (34)

ORGANISATION

24,5 h
De 8 à 12 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Liste des ressources pédagogiques remises aux participants à l'issue de la formation : polycopiés de cours et sujets de travaux en papier et/ou dématérialisés.
Tout au long de la formation, des cas pratiques ou exercices corrigés permettront à l'apprenant d'évaluer l'acquisition des compétences.

COÛT PÉDAGOGIQUE

1224 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

25032 : du mardi 04/11/2025 au vendredi 07/11/2025 à MONTPELLIER

2025
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept Oct Nov
25032		 Déc
OBJECTIFS
-

S'initier au développement en Python


-

Connaître les principes et les avantages du système Linux


-

Connaître et savoir utiliser les commandes de base permettant de lancer des programmes sous Linux


-

Comprendre, rédiger et savoir lancer des scripts en python


-

Charger et utiliser des librairies python existante

PUBLICS
Biologistes, bio-analystes, professionnels des sciences du vivant ayant besoin d'analyser des données
Toute personne désireuse de savoir analyser ou visualiser des données grâce à des scripts personnalisés
PRÉREQUIS
Notions de base en informatique : fichiers, répertoires, compression de fichiers, formats de fichiers texte et tabulaires (par CSV).
PROGRAMME
Jour 1
Matin : système linux et commandes de base
Après-midi : bases de python, notions de variables et structures de contrôles

Jour 2
Matin : scripts python : format, utilisation, fonction, exécution
Après-midi : rédaction et correction de scripts

Jour 3
Matin : bases de la librairie pandas
Après-midi : analyse et exploitation de données tabulaires avec pandas

Jour 4
Matin : analyse de données des participants
EQUIPEMENT
Un ordinateur préinstallé sous linux sera fourni aux participant.e.s, ainsi qu'un polycopié des cours (PDF ou imprimé au choix).
INTERVENANTS
E. Rivals (chercheur) et A.-M. Arigon (maîtresse de conférences)
Avis des stagiaires

"Enseignements et mises en pratique de très bonne qualité. Contenus tout à fait utiles et en lien avec les attentes." Antoine M., Organisme de recherche

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