Formation - Métabolomique ciblée et non ciblée par chromatographie et spectrométrie de masse

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Environnement scientifique et technique de la formation

Institut de biologie moléculaire des plantes

- UPR 2357

RESPONSABLE

Dimitri HEINTZ

Ingénieur de recherche

UPR 2357

LIEU

STRASBOURG (67)

ORGANISATION

2,5 jours
De 3 à 5 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Alternance de cours (5 h) et de travaux dirigés (12 h)
Tout au long de la formation, des exercices corrigés permettront au stagiaire d'évaluer son acquisition des connaissances.
Un support papier et des fichiers au format PDF seront mis à disposition du stagiaire.

COÛT PÉDAGOGIQUE

1900 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

Nous consulter

2024

Janvier	Février	Mars	Avril
Mai	Juin	Juillet	Août
Sept	Oct	Nov 24120	Déc

OBJECTIFS

S'initier aux techniques de la métabolomique (lipidomique, métabolomique environnementale, intérêts et évolutions futures des techniques)

Comprendre la problématique de la préparation de l'échantillon

Appréhender de manière pratique le dosage de métabolites ciblés par HPLC, LC-MS, GC-MS

Appréhender de manière pratique la métabolomique non ciblée par LC-MS et GC-MS

Être capable d'interpréter des données (chromatogrammes, spectres de masse, identification et quantification des métabolites)

Être capable d'intégrer les résultats (analyse statistique)

PUBLIC

Chercheurs, ingénieurs en biologie, chimie ou biochimie

PRÉREQUIS

Niveau Bac + 4 minimum en biologie, en biochimie ou en chimie

PROGRAMME

- Initiation à la métabolomique : définition et fondements, techniques et contraintes et exemples d'applications
- Préparation des échantillons : méthodes et exemples d'extraction à partir d'échantillons biologiques
- Dosage de métabolites ciblés par HPLC, LC-MS/MS et GC-MS/MS : principe général
- Profilage métabolique, métabolomique non ciblée : principe général
- Analyse statistique et intégration des données
- Suite de l'analyse statistique et intégration des données
- La problématique des bases de données et des multiples logiciels de traitement de données
- Comment faire en pratique le lien vers les données des autres analyses "omics"
- Communication des données métabolomique

Les stagiaires pourront suivre l'analyse d'une série d'échantillons biologiques de A à Z.

EQUIPEMENT

HPLC - simple Q-fraction collector (Waters), UPLC-DAD-MS/MS triple-Q (Waters), UPLC-MS/MS triple Q (Bruker), GC-MS/MS triple Q (Bruker). UPLC-Q-TOF (Bruker), UPLC- FT-ICR 7 tesla (Bruker)

INTERVENANTS

D. Heintz, J. Zumsteg et C. Villette (ingénieurs)

Avis des stagiaires

"Formation complète et didactique. Adaptation du programme remarquable. Niveau pédagogique élevé, formation remarquable qui va me permettre de poursuivre le développement en Metabolomique." Anonyme, AGILENT TECHNOLOGIES

"Présentation du traitement des données statistiques particulièrement intéressante. Grande logique dans la démarche scientifique qui a parfaitement été retranscrite tout au long de la formation." Anonyme, AGILENT TECHNOLOGIES

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