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Formation - Métabolomique non ciblée par spectroscopie RMN en biologie-santé

Environnement scientifique et technique de la formation

Institut pour l'avancée des biosciences

- UMR 5309
RESPONSABLE

Bénédicte ELENA-HERRMANN

Directrice de recherche

UMR 5309

LIEU

LA TRONCHE (38)

ORGANISATION

2,5 jours de formation
De 3 à 8 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Alternance de cours (4 h), de visite (1 h) et de travaux dirigés et pratiques (10 h).
TP en sous-groupes de 3 à 5 stagiaires.
Un fichier au format PDF sera mis à disposition du stagiaire.
Tout au long de la formation, des exercices théoriques ou pratiques corrigés permettront au stagiaire d'évaluer l'acquisition des connaissances.

COÛT PÉDAGOGIQUE

1600 Euros

DATES DES SESSIONS

Les informations indiquées pour cette page sont valables pour la première session à venir.
Avant de s'inscrire à une autre session, téléchargez son programme car des modifications mineures peuvent y avoir été apportées.

24346 : du lundi 25/11/2024 au mercredi 27/11/2024 à LA TRONCHE

25173 : du lundi 01/12/2025 au mercredi 03/12/2025 à LA TRONCHE

2024
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept Oct Nov
24346
Déc
2025
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept Oct Nov Déc
25173
NOUVEAU
OBJECTIFS
-

Connaître les principes fondamentaux de l'analyse métabolomique et le processus analytique


-

Savoir préparer un échantillon (extraits cellulaires, milieux de culture, biofluides) pour l'analyse métabolomique par spectroscopie RMN


-

Savoir réaliser l'acquisition de données de RMN (profils 1D 1H) pour l'analyse métabolomique non ciblée d'échantillons biologiques, dont l'analyse IVDr des biofluides humains


-

Connaître les principes fondamentaux et les méthodes pratiques pour l'identification des métabolites dans des mélanges complexes à partir de données RMN


-

Connaître les principes fondamentaux de l'analyse statistique multivariée des données de métabolomique

PUBLIC
Chercheurs, ingénieurs ou techniciens en sciences biologiques ou analytiques
PRÉREQUIS
Connaissances de base en biologie et/ou chimie
PROGRAMME
- Principes fondamentaux de l'analyse métabolomique et exemples d'études en recherche
- Visite de la plateforme RMN (GEMELI) et présentation de l'équipement
- Préparation des échantillons : principes fondamentaux, protocoles, standardisation et mise en pratique
- Acquisition de données RMN pour le profilage métabolique : principes fondamentaux de suppression de l'eau, RMN 1D 1H NOESY et CPMG, RMN 2D ; acquisition pratique de données RMN 600 IVDr pour des échantillons biologiques
- Analyse « IVDr » des biofluides : automatisation pour l'analyse haut-débit, contrôles qualité, références pour la quantification
-Traitement des données RMN : pré-traitement, normalisation, alignement ; quantification relative ou absolue des métabolites ; traitement automatisé pour l'analyse IVDr (biofluides)
- Analyses statistiques multivariée des données RMN
EQUIPEMENTS
Spectromètre RMN 600 MHz Bruker IVDr
Il est recommandé au stagiaire de venir avec son propre ordinateur portable.
INTERVENANTS
B. Elena-Herrmann (chargée de recherche) et J. Villaret (ingénieur de recherche)