L'organisme de formation continue du CNRS
Accueil > Caractérisation des protéines par spectrométrie de masse dans le contexte de la protéomique

Formation - Caractérisation des protéines par spectrométrie de masse dans le contexte de la protéomique

Environnement scientifique et technique de la formation

Spectrométrie de masse biologique et protéomique

- FRE 2032
RESPONSABLES

Joëlle VINH

Directrice de recherche

UMR 8249

Iman HADDAD

Ingénieure d'études

UMR 8249

LIEU

PARIS (75)

ORGANISATION

5 jours
De 5 à 10 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Alternance de cours (50 %) et de travaux pratiques (50 %)
En fin de formation, un test d'évaluation d'acquisition des connaissances sera effectué et une correction collective commentée permettra au stagiaire de se positionner sur l'atteinte des objectifs de la formation.
Un fichier au format PDF sera mis à disposition du stagiaire.

COÛT PÉDAGOGIQUE

2300 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATES DES SESSIONS

Les informations indiquées pour cette page sont valables pour la première session à venir.
Avant de s'inscrire à une autre session, téléchargez son programme car des modifications mineures peuvent y avoir été apportées.

24126 : du lundi 25/11/2024 au vendredi 29/11/2024 à PARIS

25145 : du lundi 17/11/2025 au vendredi 21/11/2025 à PARIS

2024
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept Oct Nov
24126
Déc
2025
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept Oct Nov
25145
Déc
OBJECTIFS
-

Acquérir les bases théoriques et pratiques des stratégies en protéomique bottom-up


-

Être capable d'obtenir et interpréter des spectres de masse à partir de microquantité de matériel protéique


-

Interpréter des spectres de masse MS/MS pour le séquençage des peptides


-

Savoir détecter des modifications post-traductionnelles


-

Être initié à l'identification de protéines par recherche dans les banques de séquences

PUBLICS
Techniciens supérieurs, ingénieurs, chercheurs

Prérequis : connaissances de base en biochimie et en techniques analytiques
PROGRAMME
Les stagiaires peuvent apporter un échantillon à titre pédagogique (contacter les formateurs pour les détails pratiques). La semaine est organisée avec une alternance théorie / pratique.

Formation théorique (50 % du temps environ)
- Techniques d'ionisation des macrobiomolécules d'intérêt biologique : ESI, MALDI
- Les analyseurs : TOF, quadripôles, trappes d'ions, hybrides, FT-ICR, TOF-TOF, Orbitrap
- Mesure de masse moléculaire (MS)
- Peptides, règles de fragmentation, interprétation des spectres, assistance informatique pour l'interprétation (MS/MS)
- Préparation d'échantillon, digestion
- Identification de protéines par Mass Fingerprinting
- Identification par séquençage partiel en MS/MS
- Outils informatiques pour les recherches dans les banques
- Couplage HPLC et nano HPLC
- Introduction à la quantification différentielle par MS

Travaux pratiques (50 % du temps environ)
- Identification de protéines par spectrométrie de masse : de la protéine isolée sur gel d'acrylamide ou en solution à son identification par spectrométrie de masse
EQUIPEMENTS
- Spectrométrie de masse : 2 hybrides nanoESI quadripôle-Orbitrap QExactive et QExactive-HF, 1 hybride nanoESI trappe ionique-Orbitrap LTQ-Orbitrap, une source TriVersa NanoMate Advion, MALDI TOF-TOF 5800
- Nano chromatographie en phase liquide : 2 chaînes U3000 Dionex, 3 chaînes RSLC U3000, une chaine HPLC Vanquish,un robot d'interface nanoLC MALDI Probot, ESI Orbitrap
- Logiciels disponibles : Mascot, Peaks, Byonic, MaxQuant, Proteome Discoverer, myProMS, Perseus,DIAN
INTERVENANTS
J. Vinh, N Eskenazi (chercheurs), G. Chiappetta, E. Demey, I. Haddad (ingénieurs), Y. Verdier (maître de conférences) et G. van der Rest (professeur)
Avis des stagiaires

"Très bon accueil, petit déjeuner, goûter, café, thé. Merci pour cet accueil (petit clin d'oeil pour les chocolats noisette). Des cours clairs avec des intervenants très pédagogues et passionnés. C'est une formation complète qui a répondu aux questions posées. Un grand merci à tous." Mélodie K., Institut de recherche

FORMATIONS SIMILAIRES