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Formation - Améliorer l'efficacité et la robustesse du clonage moléculaire

Environnement scientifique et technique de la formation

Institut pour l'avancée des biosciences

- UMR 5309
RESPONSABLES

Christiane ODDOU

Ingénieure d'études

UMR 5309

Olivier DESTAING

Directeur de recherche

UMR 5309

LIEU

LA TRONCHE (38)

ORGANISATION

21 h
De 4 à 7 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Alternance de cours (15,5 h) et de travaux pratiques (5,5 h)
En fin de formation, un test d'auto-évaluation d'acquisition des connaissances sera effectué et une correction collégiale commentée permettra à l'apprenant de se positionner sur l'atteinte des objectifs de la formation.
Un guide manuel des TP et des supports dématérialisés seront mis à disposition du stagiaire.

COÛT PÉDAGOGIQUE

1428 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

Nous consulter

2025
Janvier Février Mars
25227
Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept Oct Nov Déc
OBJECTIFS
-

Connaitre et comparer les différentes techniques de clonage en termes de coût et d'efficacité, afin d'optimiser les stratégies.


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Rechercher les informations de biologie moléculaire de base (séquences moléculaires, variants, structure de gènes…) dans les bases de données et logiciels dédiés.


-

Utiliser le logiciel Serial Cloner (logiciel gratuit) pour l'analyse de séquence et la conception de cartes de plasmides in silico.


-

Développer une stratégie de choix de vecteur de clonage en fonction des objectifs scientifiques, des cellules hôtes (procaryote ou eucaryote), du mode d'expression souhaitée (création de lignées stables ou transitoires), du mécanisme d'introduction de l'ADN exogène (transformation, virus, transfection, électroporation)


-

Réussir efficacement et rapidement un clonage moléculaire avec la mise en ?uvre des techniques de Gibson assembly et TA cloning


-

Connaitre les bases de la transduction cellulaire eucaryote par Retrovirus / Lentivirus et par un système de transposon (sleeping beauty)


-

Suivre et manipuler une protéine cible dans une cellule d'intérêt par la technologie d'optogénétique

PUBLIC
Techniciens, ingénieurs et chercheurs en biologie, biophysique, chimie
PRÉREQUIS
Connaissances de base en biologie moléculaire
PROGRAMME
Jour 1
- matin 3 h :
. présentation-introduction 1h30
. séance TP1 1h30 (PCR, digestion enzymatique).

- après-midi 4 h :
. séance TP2 2 h : Gibson assembly, transformation, PCR
. cours-TD 2 h : recherche de séquences, logiciel Serial Cloner

Jour 2
- matin 3h30 :
. séance TP3 1h : screening par PCR
. TD 2 h30 : construction in silico

- après-midi 4 h :
. séance TP4 1h : ligation TA cloning
. cours 3h : les différents vecteurs, transduction

Jour 3
- matin 3h30 :
. cours 2h : techniques de clonage, outils
. TD 1h30 : bilan, échange

- après-midi 3h :
. cours 1h : optogénétique
. visite plateformes microscopie / cytométrie 1h, traitements de questions et problématiques individuelles 1 h
EQUIPEMENTS
Il est demandé aux stagiaires de venir avec leur propre ordinateur portable.
Vous pouvez installer au préalable le logiciel Serial Cloner en accès gratuit.
INTERVENANTS
C. Oddou (ingénieure d'études) et I. Bourrin-Reynard (assistante ingénieure)