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Formation - CRISPRi : une application innovante pour la modulation de l'expression génique chez les bactéries

Environnement scientifique et technique de la formation

Laboratoire de microbiologie et de génétique moléculaires

- UMR 5100
RESPONSABLES

Catherine TURLAN

Ingénieure de recherche

UMR 5100

Nathalie EYNARD

Maître de conférences

UMR 5100

LIEU

TOULOUSE (31)

ORGANISATION

35 h
De 4 à 8 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

- Alternance de cours (10 h) et de travaux pratiques et dirigés (25 h)
- TP mis en place par un technicien et encadrés par une intervenante pour 4 stagiaires maximum
Tout au long de la formation, des cas pratiques ou exercices corrigés permettront à l'apprenant d'évaluer son acquisition des connaissances.
Un support papier et un fichier au format PDF seront mis à disposition du stagiaire.

COÛT PÉDAGOGIQUE

2040 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

25234 : du lundi 16/06/2025 au vendredi 20/06/2025 à TOULOUSE

2025
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin
25234
Juillet Août
Sept Oct Nov Déc
OBJECTIFS
-

Découvrir une nouvelle stratégie de génie génétique pour moduler l'expression d'un gène bactérien sans modifier sa séquence


-

Comprendre la domestication des systèmes CRISPR (CRISPR interférence) pour la modulation de l'expression génique (CRISPRi)


-

Définir le gène cible et l'ARN guide


-

Construire le(s) plasmide(s) permettant de moduler l'expression du gène d'intérêt


-

Utiliser un logiciel de clonage et d'analyse des génomes bactériens

PUBLIC
Ingénieurs, chercheurs, techniciens en biologie, biotechnologie, pharmacologie et agroalimentaire
PRÉREQUIS
Connaissances en biologie moléculaire et en génétique microbienne ou bactérienne : niveau Bac + 2
PROGRAMME
Cours :
- Systèmes CRISPR, une immunité adaptative bactérienne unique
- Diversité, limites (anti-CRISPR), domestication, application des systèmes CRISPR
- Principe de la modulation transcriptionnelle de l'expression d'un gène par CRISPRi (opéron, gène essentiel, etc.)
- Bien choisir son outil CRISPR (banque Addgene)
- Notions à connaître pour moduler efficacement le niveau d'expression du gène d'intérêt

Travaux pratiques et dirigés :
- Design des ARN guides à l'aide d'un logiciel de clonage (snapgene viewer)
- Préparation des vecteurs d'expression de la protéine Cas et de l'ARN guide - Transformation d'Escherichia coli et sélection des clones d'intérêt
- Test phénotypique sur boîte
- Quantification de l'expression génique en fonction de l'induction du système CRISPRi
EQUIPEMENTS
Matériel standard d'un laboratoire de biologie moléculaire et de microbiologie
Il est demandé aux stagiaires de se munir de leur propre ordinateur portable avec les droits administrateurs afin de pouvoir installer en début de stage les logiciels nécessaires à la formation.
INTERVENANTS
C. Turlan (ingénieur de recherche), N. Eynard (maître de conférence) et A.-M. Cirinesi (technicienne)