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Formation - Ingénierie du génome associée à CRISPR pour générer des mutations sans cicatrice chez les bactéries

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RESPONSABLES

Catherine TURLAN

Ingénieure de recherche

UMR 5100

Wladimir MALAGA

Ingénieur d'études

UMR 5089

LIEU

TOULOUSE (31)

ORGANISATION

35 h
De 4 à 8 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Tout au long de la formation, des cas pratiques ou exercices corrigés permettront à l'apprenant d'évaluer l'acquisition des compétences.
Un support papier et un fichier au format PDF seront mis à disposition des stagiaires.

COÛT PÉDAGOGIQUE

2040 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

25239 : du lundi 23/06/2025 au vendredi 27/06/2025 à TOULOUSE

2025
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin
25239		 Juillet Août
Sept Oct Nov Déc
OBJECTIFS
-

Connaître les principes de la contre-sélection grâce au système CRISPR-Cas9
-

Définir et exprimer un ARN guide
-

Définir et construire un ADN mutagène
-

Sélectionner les clones porteurs de la mutation d'intérêt
-

Modifier le génome d'Escherichia coli (E. coli) sans laisser de cicatrice sur son chromosome

PUBLIC
Ingénieurs, chercheurs et techniciens en biologie, biotechnologie, pharmacologie et agroalimentaire
PRÉREQUIS
Connaissances en biologie moléculaire et en génétique microbienne ou bactérienne : niveau Bac + 2
PROGRAMME
Alternance de cours et de travaux pratiques et dirigés
TP mis en place par un technicien et encadrés par une intervenante pour 4 stagiaires maximum

Cours
- Les méthodes d'ingénierie génétique chez E. coli
- Leurs intérêts et leurs limites
- Les systèmes CRISPR : une immunité adaptative bactérienne unique
- L'utilisation du système CRISPR-Cas9 pour contre-sélectionner certaines bactéries
- Comment modifier le génome bactérien sans générer de cicatrice au niveau de sa séquence ?

Travaux pratiques et dirigés
- Présentation du système expérimental : souche, plasmides « helpers »
- Design et construction de l'ADN mutagène
- Design et clonage de l'ARN guide permettant la contre-sélection des bactéries « wild type »
- Mise en place du système expérimental : transformation, sélection, vérification
- Elimination des plasmides « helpers »
EQUIPEMENTS
Matériel standard d'un laboratoire de biologie moléculaire et de microbiologie.
Il est demandé aux stagiaires de se munir de leur propre ordinateur portable avec les droits administrateurs afin de pouvoir installer en début de stage les logiciels nécessaires à la formation.
INTERVENANTS
C. Turlan (ingénieure de recherche), W. Malaga (ingénieur d'études) et A.-M. Cirinesi (technicienne)