L'organisme de formation continue du CNRS
Accueil > Préparer des banques NGS à partir des petits ARN pour la technologie Illumina

Formation - Préparer des banques NGS à partir des petits ARN pour la technologie Illumina

Se préinscrire ou s'inscrire à cette formation Télécharger cette fiche
Environnement scientifique et technique de la formation

Institut de biologie intégrative de la cellule

- UMR 9198
RESPONSABLES

Céline HERNANDEZ

Ingénieure de recherche

UMR 9198

Erwin VAN DIJK

Ingénieur de recherche

UMR 9198

LIEU

GIF-SUR-YVETTE (91)

ORGANISATION

18 h
De 4 à 8 stagiaires

MÉTHODES PÉDAGOGIQUES

Les supports pédagogiques seront fournis aux stagiaires à l'issue de la formation.
En fin de formation, un test d'évaluation d'acquisition des connaissances sera effectué et une correction collective commentée permettra au stagiaire de se positionner sur l'atteinte des objectifs de la formation.

COÛT PÉDAGOGIQUE

2040 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires ; attestation de formation

DATE DU STAGE

25238 : du mercredi 04/06/2025 au vendredi 06/06/2025 à GIF-SUR-YVETTE

2025
Janvier Février Mars Avril
Mai Juin
25238		 Juillet Août
Sept Oct Nov Déc
OBJECTIFS
-

Comprendre la technologie de séquençage Illumina


-

Comprendre les différentes techniques de préparation de banques petits ARN et leurs avantages et inconvénients


-

Comprendre les aspects techniques de banques à partir de différents types de petits ARN (small RNA : miRNA, tRNA, RIP/CLIP-seq, Ribo-seq...)


-

Préparer une banque petits ARN de façon autonome


-

Maîtriser la quantification, qualification et validation des banques petits ARN

PUBLICS
Chercheurs, ingénieurs, techniciens
Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.
PRÉREQUIS
Connaissances de base en biologie moléculaire
PROGRAMME
A partir du jour 2, les parties théoriques se déroulent pendant les temps d'attente des protocoles.

Jour 1
Matin :
Théorique : Séquençage à haut débit (45min)
Théorique : Methodes d'extraction d'ARN (30min)
Théorique : Protocoles de préparation de banques (45min)
TP : Présentation du TP (45min)

Après-midi :
TP : Préparation des échantillons et QC
Théorique : Petits ARN circulants/biomarqueurs (45min)

Jour 2
Matin :
TP : Préparation des banques (1/2)
Théorique : Analyse bioinformatique (45min)

Après-midi :
TP : Préparation des banques (2/2)
Théorique : Ribo-seq, Isabelle Hatin (45min)
Théorique : CLIP/RIP-seq, CRAC, Domenico Libri (45min)

Jour 3
Matin :
Discussions : Evaluation du run de séquençage (1h)
TP : Préparation de banques d'ARN total (1/2)

Après-midi :
TP : Préparation de banques d'ARN total (2/2)
Discussions
Conclusions, fin de la formation
EQUIPEMENT
Petit équipement de laboratoire (pipettes, micro centrifugeuse, vortex...), thermocycleur 9700 Geneamp PCR system, Bioanalyzer 2100, séquenceur Illumina NextSeq550/2000. Voir le site internet de la plateforme de séquençage de l'I2BC pour une description plus détaillée des équipements.
INTERVENANTS
Y. Jaszczyszyn, D. Naquin (ingénieurs d'études), E. van Dijk, C. Hernandez (ingénieurs de recherche) et autres membres de la plateforme de séquençage I2BC, D. Libri (chercheur, IGMM), I. Hatin (ingénieure de recherche, I2BC)